项目是一个过程，所以水利工程项目管理是一个过程的管理，管理是主要通过计划、组织、实施、分析纠偏，最终实现原定总目标这样一个过程。工程项目管理主要分为决策阶段、准备阶段、实施阶段以及运营阶段的管理。水利工程项目由于地质条件复杂等特点，所以水利工程项目的管理是一项复杂的系统工程。
　　1  水利工程项目决策阶段的管理
　　水利工程项目是否要建设、怎么建、为谁建及其建设后的社会效益以及经济效益都要研究分析清楚，这也是决策阶段的主要任务。
　　可以通过组织措施，邀请水利产业及水利行业的权威专家参与水利工程项目立项研讨论证会。产业专家主要论证的是建成项目之后的社会效益以及经济效益，行业专家主要论证的此工程项目建设过程中的技术难点以及解决方案，这样的论证会一定要邀请专家到项目建设实地调研，这样论证会才会做到实事求是，有的放矢。
　　2  水利工程項目准备阶段的管理
　　2.1 地质勘查
　　水利工程项目建议书获批后，应根据项目的特点，通过组织措施招标方式，引入竞争机制，选择地质勘查资质、人员、技术指标及业绩与此项目相匹配的地质勘查单位，实地进行地质勘查。通过合同措施，在合同里约定好配备的技术人员与设备，根据实际工期约定人员及设备的数量。按照技术要求及工期要求将勘查分成若干个分项，应用经济措施，明确资金支付额度以及支付条件。同时，现场派驻技术人员对其进行现场管理。当地质勘查报告初稿完成后，最好组织行业专家到现场进行核对与评审。最终获得一份高质量的地质勘查报告，为编写项目的可行性研究报告、初步设计以及施工图设计奠定良好的基础。
　　2.2 可行性研究报告及初步设计的编制
　　可行性研究报告及初步设计的编制可以通过组织措施招标，引入竞争机制，选择资质及业绩与项目相匹配、人员配置强的编制单位。通过合同措施，在合同条款里，明确技术指标、人员配置数量及编制期限，按照约束条款，明确付款额度及支付条件。同时，编制人员一定要做现场调研，作为项目法人要给编制单位提供必要的技术等资料。报告初稿形成后，召开专家评审会，邀请行业专家及产业专家对其进行评价，从而使可行性研究及初步设计的质量得以控制。

2.3 施工图设计
　　通过招标确认设计单位后，要组织设计单位的主要技术人员针对地质勘察报告进行现场调研，对原始地貌进行测绘。按照项目的可行性研究报告及项目的终极目标进行施工图纸设计。在此之前一定要按照设计工期需求，在施工图纸设计委托合同里明确设计技术人员的合理配置，明确支付额度与支付条件以及未达到阶段目标的赔付条款、违约责任。同时，项目法人一定要组织设计单位进行现场调研，并给设计方提供相应的地质勘查报告及其他与工程项目有关的资料，作为工程项目施工图纸的设计依据。从而确保施工图纸保质、保量、保工期地完成设计，确保施工单位的如期招标。
　　完成了施工图纸的设计，即可委托招标代理公司进行施工单位的招标。

　　3  水利工程项目实施阶段的管理
　　到了实施阶段，首先通过组织措施，由监理单位组织召开第一次工地例会，完成项目法人或建设方对监理单位的授权，明确各参建方相应的权、责、利，并会后由监理单位形成第一次工地例会会议纪要，作为以后的管理及处罚的依据。
　　施工前，监理单位一定要对施工单位所报的开工资料进行严格审核，主要人员、设备的到场情况，必须要和投标文件及合同承诺的人员、设备及数量要一致。同时，施工组织设计一定要有适用性和可行性。由项目法人或建设单位组织勘查单位、设计单位、监理单位及施工单位，对施工图纸进行图纸会审，对施工图纸进行完善及修正。以上工作完成后，均可开工建设。
　　在施工过程中，主要是针对施工的质量、进度、成本及安全进行管理。在管理的过程中，还是要有效地对人员管理，所有主体的实施者还是人，所以管理的成与败还是人员的管理。
　　在主体施工，技术员一定要将图纸的所有技术指标和要点要给各个施工班组进行交底，在施工的过程中按照工序进行核验，核验合格后方可进行下一道工序。最大的成本控制就是施工单位能够按照图纸会审后施工图纸进行施工，人员、机械等安排合理，一次性完成合格工程。项目经理的施工日志必须和工程施工的进度及实际情况相一致，这样也便于将来出了问题进行核查。
　　安全管理首先要对所有人员进行安全三级教育，并且核对人与合同承诺人员相一致;按照工程项目的特点分析相对的危险源，结合危险源的特点制定安全管理措施及安全应急预案，杜绝安全事故的发生。
　　待工程竣工验收后，通过决算，对整个工程项目的建设及管理情况做评价，看看最终的决算额是否超过初步设计里的工程概算，如果没有超，说明成本控制得好;如果超了，说明当初的计划出了偏差，如果在偏差范围之内，说明项目管理水平是合格的。如果超出偏差范围了，就要严格地分析其原因，根据情况追究相应责任人的责任。
　　4  水利工程项目运营阶段的管理
　　根据项目的运营目标及职能划分，成立项目运营法人，组建运营管理架构。将运营目标进行分解，分析、研判及落实每一个分解目标，责任到人，万事做到有计划、有实施、有总结，确保总目标的实现。